L ’UCU mène des programmes de recherche dans divers domaines fondamentaux. Ces programmes sont repartis parmi huit instituts:
- L’Institut de l’Histoire de l’Eglise
- L’Institut de la Religion et de la Société
- L’Institut du Droit Canon
- L’Institut de Pédagogie Catéchétique
- L’Institut du Mariage et de la Famille
- L’Institut de Recherche Liturgique
- L’institut de Terminologie Théologique et de Traduction
- L’Institut de Recherche Néo-Latine
- Institut d’Études Œcuméniques
Les instituts de l’UCU sont une composante essentielle de sa mission de formation et de recherche.
Le développement d’une base de recherche approfondit et élargit le niveau des connaissances théologiques, historiques, linguistiques et des connaissances en sciences sociales. Par exemple, le premier institut de l’UCU, l’Institut de l’histoire de l’Eglise, compile des archives importantes concernant l’Eglise des catacombes qui serviront à des générations de chercheurs. Le développement d’une base de recherche servira de soutien aux programmes de licence et de doctorat.
Les activités d’édition de l’UCU répondent à une demande qui dépasse celle de l’Université elle-même avec de nouvelles publications dans divers domaines de recherche.
La formation à la recherche attire diversement les étudiants vers les activités de recherche dans les divers instituts de l’Université.
Dans la mesure ou chaque Institut a été créé pour répondre à des besoins spécifiques de l’Eglise et de la société, par conséquent les divers projets de recherche des Instituts font partie de la mission chrétienne de l’UCU.

